Alğan’ın vefatı, yakınlarını ve tüm gazileri derin bir üzüntüye boğdu. Halil Alğan’ın cenazesi, ailesinin isteği üzerine memleketi Mardin’in Midyat ilçesi Şenköy'de son yolculuğuna uğurlandı. Törende, Halil Alğan’ın ailesi duygu dolu anlar yaşarken FETÖ'ye lanetler okundu.
Cenaze törenine, Mardin Valisi ve Büyükşehir Belediye Başkavekili Tuncay Akkoyun, Ak Parti Mardin Milletvekili Faruk Kılıç, ailesi ve yakınlarının yanı sıra çok sayıda vatandaş katıldı.